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生物信息技术服务——基因组分析、转录组分析、蛋白质组分析、系统生物学分析

  • 发布日期:2016-12-13 15:13
  • 有效期至:长期有效
  • 商机区域:北京
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详细说明
地区: 北京
简介: 生物信息
提供商: 西农生(北京)生物技术有限公司
服务名称: 生物信息技术服务——基因组分析、转录组分析、蛋白质组分析、系统生物学分析


、基因组分析
重测序分析:

寻找SNP,indel 插入缺失分析,CNV拷贝数变异分析,群体遗传学等

 

转录位点分析

SNP芯片分析

基因组功能注释与分析

通过生物信息学的方法解读微生物的基因组信息,使人们迅速得获得一个微生物的大部分基因功能信息;利用获取的信息与已知的近缘微生物基因组进行比较分析,进一步挖掘序列背后的生物学意义,为生物学家提供指导。

功能基因组注释
l 基因预测 
l 基因功能注释 
l 蛋白质功能分类
l 蛋白质亚细胞定位
l rDNA和tRNA基因预测
l IS element和Prophage预测

功能基因组分析
l Paralog和Ortholog计算
l 代谢通路的构建
l 基因岛和水平转移基因的发现
l 基因组多态性的分析
l 基于同源基因的DN/DS计算的进化分析

二、转录组分析

服务介绍

 

1.  RNA-Seq分析:差异表达,时间序列表达分析等。

 

2.miRNA表达分析

 

 

3.基因表达芯片分析




三、
蛋白质组分析

 

 


标准分析A:(包含必选的基础分析模块和基于公共数据库分析的订制模块)
A1. 差异蛋白的综合注释。
A2. 基于注释结果的聚类分析。
A3. 基于Gene Ontology的差异蛋白的富集分析(生物学途径/细胞学功能/亚细胞定位等)。
A4. 显著激活通路的富集分析及可视化分析。
A5. gene-phenotype-disease关联分析。
 
 
 
可选分析B:(包含基于专业/商业化数据库系统所提供的出版级数据分析,为高级别杂志所广泛采用的深入型分析)
B1. 差异蛋白的潜在调控模式分析(miRNA/Transcription Factor/Target )。
B2. 差异蛋白的相互作用网络分析。 
B3. 基于GeneMania/IPA数据库的系统生物学分析,药物处理后表型相关子网络及其调控模块分析。
 
这部分为我们所推荐的特色分析,供您选择。
 
我们会根据你的具体需要和研究背景,在分析过程中调整重心,做更有针对性的靶向分析(例如细胞骨架/凋亡/自噬的相关调控模式和新靶点分析)



四、系统生物学分析

 

   

Gene Ontology分析
Pathway 通路分析
基因网络构建
数据整合
功能模块发现
关联分析(Association Study)

 
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